Tabung silikon food grade umumnya tidak dianjurkan untuk bersentuhan langsung dengan disinfektan. Meskipun tabung silikon dapat mentolerir bahan kimia tertentu dalam beberapa kasus, disinfektan sering kali mengandung oksidan kuat, klorida, alkohol, atau komponen kimia korosif dan reaktif lainnya yang dapat bereaksi dengan gel silikon, menyebabkan korosi permukaan, pengerasan, perubahan warna, atau penurunan kinerja tabung silikon.
Misalnya, meskipun reaksi antara natrium hidroksida dan gel silikon relatif ringan pada suhu kamar, reaksi antara natrium hidroksida dan gel silikon dapat terjadi pada suhu tinggi, sehingga mempengaruhi kinerja tabung silikon. Demikian pula, disinfektan yang mengandung klorin seperti natrium hipoklorit memiliki sifat pengoksidasi yang kuat dan dapat merusak struktur kimia gel silika. Meskipun disinfektan alkohol tidak terlalu menyebabkan iritasi, paparan jangka panjang juga dapat menimbulkan efek buruk pada gel silikon.
